Ο Iωάννης-Γκύνtερ Α ́, γερμ.: John (ή Johann ή Hans) Günther I of Schwarzburg-Sonders,hausen (20 Δεκεμβρίου 1532 στο Σοντερσαούζεν - 28 Οκτωβρίου 1586 στην Άρνσταττ) από τον Οίκο του Σβάρτσμπουργκ ήταν ο συγκυβερνήτης τού Σβάρτσμπουργκ από το 1552 έως το 1571, και ο μοναδικός κυβερνήτης τού Σβάρτσμπούργκ-Ζόντερσχαουζεν από το 1571 μέχρι το τέλος του. Θεωρείται ο γενάρχης τού κλάδου Σβάρτσμπουργκ-Ζόντερσχαουζεν.
Ήταν γιος τού Γκύντερ Μ΄ κόμη του Σβάρτσμπουργκ (1490-1552), τού λεγόμενου Πλουσίου ή με τα Μεγάλα Σαγόνια, και τής συζύγου του Ελισάβετ (απεβ. 14 Μαΐου 1572), κόρη τού Φίλιππου κόμη τού Ίζενμπεργκ-Μπύντινγκεν-Ρόνεμπουργκ.
Ο Ιωάννης Γκύντερ Α΄ μεγάλωσε ως Καθολικός και προοριζόταν για μία εκκλησιαστική σταδιοδρομία. Ωστόσο, μετά το τέλος τού πατέρα του, μεταστράφηκε στον Λουθηρανισμό. Πέρασε κάποιο χρόνο στην Αυλή τού Μαυρικίου εκλέκτορα της Σαξονίας, και πολέμησε στη Μάχη του Σήβερσχαουζεν με τη πλευρά τού Μαυρικίου εναντίον τού Αλβέρτου-Αλκιβιάδη μαργράβου του Βρανδεμβούργου-Κούλμπαχ. Ο διάδοχος του Μαυρικίου, Αύγουστος της Σαξονίας, επιβεβαίωσε το προνόμιο τού να εισπράττει δασμούς στο εμπόριο τού αλατιού στο Φράνκενχαουζεν.
Μετά το τέλος τού πατέρα του, ο Ιωάννης-Γκύντερ Α΄ άρχισε αρχικά να κυβερνά το Σβάρτσμπουργκ μαζί με τους τρεις αδελφούς του. Επέλεξε την πόλη Ζόντερσχαουζεν ως κατοικία του. Το 1571, οι αδελφοί αποφάσισαν να διαιρέσουν την κομητεία. Το μερίδιο τού Ιωάννη-Γκύντερ Α΄ ονομάστηκε Σβάρτσμπουργκ-Ζόντερσχαουζεν, από την πρωτεύουσά του.
Πολέμησε στις Κάτω Χώρες μαζί με τον μεγαλύτερο αδελφό του Γκύντερ ΜΑ΄ και διακρίθηκε κατά τη διάρκεια της κατάκτησης του Σαιν-Καντέν το 1583.
Μετά το τέλος των αδελφών του Γκύντερ ΜΑ΄ του Σβάρτσμπουργκ-Άρνστατ και του Γουλιέλμου Α ́ του Σβάρτσμπουργκ-Φράνκενχαουζεν χωρίς άρρενες κληρονόμους, ο Ιωάννης-Γκύντερ Α ́ κληρονόμησε το Σβάρττσμπουργκ-Άρνστατ, ενώ ο εναπομείναν αδελφός του Αλβέρτος Ζ΄ κληρονόμησε το Σβάρτσμπουργκ-Φράνκενχαουζεν.
Νυμφεύτηκε στις 16 Φεβρουαρίου 1566 την Άννα (1539-1579), κόρη του Αντωνίου Α΄ κόμη του Όλντενμπουργκ. Είχαν τα ακόλουθα παιδιά: