Το 1612 όταν ο Αχμέτ Α΄ επιτέθηκε στην Αυστροουγγαρία αυτός ετοίμασε στρατό 20.000 στρατιωτών και ετοιμάστηκε να τον πολεμήσει. Τον Νοέμβριο του 1612 κατάφερε να νικήσει τον Αχμέτ Α΄ στο Κέτσκεμετ και λίγες μέρες αργότερα στο Ζάλαεγκερζεγκ. Ο Αχμέτ Α΄ παράτησε τα σχέδια του και κίνησε για την Κωνσταντινούπολη. Το 1615 επιτέθηκε στους Παξούς κι έτσι άρχισε ξανά ο πόλεμος, μετά από λίγο ο Αχμέτ κατάκτησε και την Κέρκυρα. Τον Ιούνιο του 1616 ο Αχμέτ Α΄ επιτέθηκε στο Παλέρμο κι έτσι ξανάρχισε ο πόλεμος όμως ο Αχμέτ Α΄ έχασε στη Μάχη της Τζέλα κι έτσι απέσυρε τα σχέδια του. Τον Αύγουστο του 1616 ο Αχμέτ Α΄ επιτέθηκε στους Παξούς και τους κατάκτησε ενώ τον Μάρτιο του 1617 κατέκτησε την Κέρκυρα. Στις 21 Νοεμβρίου ο Ματθίας επιτέθηκε στην Ριγιέκα όπου και κατάκτησε. Τον Νοέμβριο του 1618 ο Ματθίας επιτέθηκε στην Λιουμπλιάνα αλλά μετά από μια σύντομη μάχη αναγκάστηκε να υποχωρήσει. Το 1618 ξέσπασε η εξέγερση της Βοημίας, η πρώτη φάση του Τριακονταετούς Πολέμου. Πέθανε το 1619. Τον διαδέχθηκε ο εξάδελφός του, Φερδινάνδος Β΄.