Der Zyprische Fußballpokal 1948/49 war die zwölfte Austragung des zyprischen Pokalwettbewerbs. Er wurde vom zyprischen Fußballverband ausgetragen. Das Finale fand zunächst am 3. April 1949 im GSP-Stadion von Nikosia statt, musste aber aufgrund von Ausschreitungen am 19. Juni 1949 an gleicher Stelle wiederholt werden.
Pokalsieger wurde Anorthosis Famagusta. Das Team setzte sich im Finale gegen APOEL Nikosia durch.
Alle Begegnungen wurden in einem Spiel ausgetragen. Bei unentschiedenem Ausgang wurde das Spiel um zweimal 15 Minuten verlängert. Stand danach kein Sieger fest, folgte ein Wiederholungsspiel auf des Gegners Platz.
Die Spiele fanden am 13. März 1949 statt.
Das ursprüngliche Finale fand am 3. April 1949 im GSP-Stadion von Nikosia statt. Während APOEL mit 3:2 führte, kam es zu Auseinandersetzungen zwischen den Spielern beider Mannschaften, die auch auf die Zuschauer übergriffen. Das Spiel wurde in der 87. Minute abgebrochen. Der zyprische Fußballverband beschloss, das Spiel am 19. Juni 1949 an gleicher Stelle zu wiederholen.
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