1993 bei einem Reitturnier im italienischen Modena, bei dem Nagel im Team mit Ludger Beerbaum, Franke Sloothaak und Holger Hetzel den Nationenpreis gewonnen hatte, wurde sein Olympiapferd Leroy Brown positiv auf Isoxoprin getestet. Nagel stritt ab, etwas damit zu tun zu haben. Im Herbst 1998 wurde er nach einem über fünf Jahre dauernden Prozess vom Vorwurf des Dopings freigesprochen. Sowohl die Sperre als auch die Geldstrafe wurden aufgehoben, sein Pferd dagegen blieb gesperrt.[3]
2005 gewann er in Kopenhagen seinen letzten Nationenpreis. Dort war er 2011 auch erstmals als Equipechef für eine deutsche Mannschaft bei Nationenpreisen tätig.[4]
Seit 2007 arbeitet Nagel als Trainer und Koordinator der Nachwuchspferde von Paul Schockemöhle sowie als Trainer des Springreiters Dirk Ahlmann.