1994 wurde Wimmer an der Hebräischen Universität Jerusalem in Ägyptologie mit einer Arbeit zur hieratischenPaläografie nicht-literarischer Ostrakapromoviert. Er wirkte an diversen, auch internationalen Projekten mit (unter anderem „Deir el Medine online“, LMU[1]; „Philisterprojekt“, German-Israeli Foundation[2]; „Die ägyptische und orientalische Rubensohn-Bibliothek, aramäische Texte aus Elephantine“, Papyrussammlung Berlin[3]), war 1998 bis 2005 wissenschaftlicher Assistent von Manfred Görg an der Katholisch-Theologischen Fakultät der Universität München und habilitierte sich 2008 an der Kulturwissenschaftlichen Fakultät der Universität München. 2016 wurde er zum außerplanmäßigen Professor ernannt.
2006 wurde ihm der Dialogpreis des Interkulturellen Dialogzentrums München (IDIZEM) verliehen; im selben Jahr nahm er für die Freunde Abrahams den Förderpreis Münchner Lichtblicke des Ausländerbeirats der Landeshauptstadt München und der Lichterkette e.V. entgegen,[9] 2017 ebenfalls für die Freunde Abrahams den Bürgerpreis des Bayerischen Landtags.[10]
Publikationen
Bücher (Auswahl)
Von Sulzbach bis Tel Aviv. Hebräische Neuerwerbungen aus 50 Jahren – 1965–2015. Bayerische Staatsbibliothek, München 2015, ISBN 978-3-88008-009-6 (deutsch und hebräisch).
mit Ernst Wagner, Leyla Sedghi: Isar-Arabesken. Spuren des Orients in München (= Münchner STATTreisen. Band 6). Allitera-Verlag, München 2013, ISBN 978-3-86906-105-4.
München und der Orient. Mit Fotografien von Ergün Cevik und einem Geleitwort von Christian Ude. Kunstverlag Josef Fink, Lindenberg im Allgäu 2012, ISBN 978-3-89870-774-9.
mit Benjamin Idriz, Stephan Leimgruber (Hrsg.): Islam mit europäischem Gesicht. Perspektiven und Impulse. Butzon & Bercker, Kevelaer 2010, ISBN 978-3-7666-1397-4.
Palästinisches Hieratisch. Die Zahl- und Sonderzeichen in der althebräischen Schrift (= Ägypten und Altes Testament. Band 75). Harrassowitz, Wiesbaden 2008, ISBN 978-3-447-05862-9 (zugleich Habilitationsschrift).
Abu Safíja, Maria, woher hast du das? Frauengestalten im Koran. Edition Avicenna, München 2008, ISBN 978-3-9809384-4-0.
mit Stephan Leimgruber: Von Adam bis Muhammad. Bibel und Koran im Vergleich. Verlag Katholisches Bibelwerk, München/Stuttgart 2005; 2. Auflage, ebd. 2007, ISBN 978-3-460-33175-4.
Vergangene Tage – Neues Erwachen. Jüdisches Leben in München. Ein Stadtrundgang. München-Verlag, München 2006, ISBN 978-3-937090-18-4.
Maschallah – Muslime in München. Stattreisen München e.V., München 2005/2006.
mit August Strobel: Kallirrhoë ('Ēn ez-Zāra). Dritte Grabungskampagne des Deutschen Evangelischen Instituts für Altertumswissenschaft des Heiligen Landes und Exkursionen in Süd-Peräa (= Abhandlungen des Deutschen Palästina-Vereins. Band 32) Harrassowitz, Wiesbaden 2003, ISBN 3-447-04735-6.
Hieratische Paläographie der nicht-literarischen Ostraka der 19. und 20. Dynastie (= Ägypten und Altes Testament. Band 28). 2 Bände, Harrassowitz, Wiesbaden 1995, ISBN 3-447-03776-8 (zugleich Dissertation).
Herausgeberschaft (Auswahl)
zusammen mit Georg Gafus: „Vom Leben umfangen“. Ägypten, das Alte Testament und das Gespräch der Religionen. Gedenkschrift für Manfred Görg. (= Ägypten und Altes Testament. Band 80). Ugarit, Münster 2014, ISBN 978-3-86835-119-4.
Ägypten und Altes Testament. Studien zu Geschichte, Kultur und Religion Ägyptens und des Alten Testaments. (Schriftenreihe, ISSN0720-9061; 2009–2012 hrsg. von Manfred Görg und Stefan Wimmer, seit 2014 hrsg. von Stefan Wimmer und Wolfgang Zwickel).
Blätter Abrahams. Beiträge zum interreligiösen Dialog. (Zeitschrift, ISSN1613-8384; 2002–2012 hrsg. von Manfred Görg und Stefan Jakob Wimmer, seit 2013 hrsg. von Stefan Jakob Wimmer und Georg Gafus).
Artikel
über 100 Fachartikel, Lexikonbeiträge, Rezensionen, Editorials
Literatur
Theresia Lipp: „Gott lässt sich nicht beschreiben“ - Stefan Jakob Wimmer engagiert sich mit den „Freunden Abrahams“ im interreligiösen Dialog. In: Münchner Kirchenzeitung vom 29. Oktober 2017.
Bernd Kastner: Der Vermittler. In: Süddeutsche Zeitung vom 14./15. August 2013.
Werner Siefer: Ur-Alphabet in Israel entdeckt. In: Focus 37/2009 vom 7. September 2009.
Jan Kirsten Biener: Die Reise nach Jerusalem – und wieder zurück. In: Tatiana Hänert, Marta Reichenberger (Hrsg.), Galerie der echten Münchner. Ein Projekt zum 850. Stadtgeburtstag. Landeshauptstadt München - Kulturreferat, München 2008, S. 90–93.
↑Konzept für Gedenkstättenarbeit. In: Dachauer Neueste vom 7. April 1999.
↑Auf Spurensuche nach jüdischem Leben in München. In: Süddeutsche Zeitung vom 8./9. April 1993. Wo München islamisch ist. In: Süddeutsche Zeitung vom 31. Oktober/1. November 2001.