St Mary’s Loch ist sichelförmig gebogen und hat die typisch langgezogene Form eines in der Eiszeit durch Gletscher entstandenen Sees. Er ist circa fünf Kilometer lang, aber nur maximal 800 m breit. Der See erhält Wasser aus zahlreichen Flüssen und
Bächen. Die größten davon sind Megget Water, der St Mary’s Loch im Westen mit Wasser aus dem Megget Reservoir
speist, und der nur etwa 150 m lange Zufluss aus dem unmittelbar südwestlich gelegenen Loch of the Lowes. Weitere Zuflüsse sind Summerhope Burn, March Sike, Bowerhope Burn, Brocklie Sike, Kirkstead Burn und Willies Grain. Im Nordwesten entwässert St Mary’s Loch in den Fluss Yarrow Water, dessen Quelle er ist.
St Mary’s Loch ist über die gut ausgebaute A708 sowohl von Selkirk als auch von Moffat aus leicht zu erreichen. Beliebt ist der See vor allem bei Anglern. Gefangen werden in erster Linie Forellen. Am Südende des Sees befindet sich ein Denkmal für den schottischen Schriftsteller James Hogg, in dessen Dichtung der See Eingang gefunden hat. Gedichte über St Mary’s Loch existieren darüber hinaus von William Wordsworth und von Sir Walter Scott.
