Die Kirche St. Thomas (kostel svatého Tomáše) ist die Stiftskirche des ehemaligen Augustinerklosters auf der Prager Kleinseite. Das gesamte Areal ist als Kulturdenkmal eingetragen.[1]
Die Kirche steht an der Stelle der ursprünglich kleineren romanischen St.-Thomas-Kirche und St.-Dorothea-Kapelle, deren Reste im Chorbereich erhalten sind. 1285 wurden von König Wenzel II. zum Gedenken an seinen Vater Přemysl Otakar II. eine Kirche gestiftet und Augustiner-Eremiten angesiedelt. Anschließend entstand in zwei Bauabschnitten eine dreischiffige gotische Basilika, deren langgestreckter Chor 1316 geweiht wurde. Fertiggestellt war die Kirche erst nach dem Tod des Kaisers Karl IV. im Jahr 1379. In den Hussitenkriegen wurde das Kloster teilweise zerstört.[1]
Die Klostergebäude wurden mehrfach umgebaut. Ihr heutiges Aussehen erhielten sie nach einem Umbau im 17. Jahrhundert. Die gotische St.-Barbara-Kapelle besitzt ein Renaissanceportal aus dem Jahr 1596. Ihr Altarblatt von Joseph Heintz d. Ä. aus der Zeit um 1600 zeigt die Heilige Familie mit Engeln sowie die Heiligen Barbara und Katharina. Das Kloster dient heute als Altersheim.
Die 1358 gegründete Thomasbrauerei/Pivovar u sv. Tomáše bestand bis 2005, ehe 2009 das Hotel The Augustine eröffnete und der historische Thomaskeller als Hotelbar umgebaut wurde.