Marija Pejčinović Burić wuchs in Ljubuški als Tochter eines Lehrer-Ehepaares auf und schloss das Gymnasium bereits im Alter von 17 Jahren ab. Sie studierte 1980 bis 1985 Ökonomie an der Universität Zagreb und graduierte. Danach war sie insgesamt 3 Jahre lang als Au-pair in Paris, London und Salamanca, um ihre Sprachkenntnisse zu verbessern. Von 1988 bis 1991 arbeitete sie im Bereich Außenhandel des Elektro-Unternehmens Rade Končar.
1991 bis 1994 war sie Stellvertretende Generalsekretärin der Europäischen Bewegung Kroatien (Europski pokret Hrvatska), dem kroatischen Ableger der Europäischen Bewegung International, und bis 1997 Generalsekretärin bzw. Direktorin des von dieser Organisation betriebenen Europäischen Hauses (Europski dom) in Zagreb. Parallel dazu absolvierte sie ein Studium am College of Europe in Natolin (Warschau). Es folgte eine Position in der Öffentlichkeitsarbeit der Pharmakonzerns Pliva.
2008 bis 2011 war sie Abgeordnete des kroatischen Parlaments. Nach dem Rücktritt des bisherigen Außenministers Davor Stier trat sie am 19. Juni 2017 dessen Nachfolge an. Am 26. Juni 2019 wurde Pejčinović Burić von der parlamentarischen Versammlung des Europarates zur neuen Generalsekretärin gewählt. Sie folgte am 18. September 2019 auf Thorbjørn Jagland.[3] Sie hat das Amt noch bis zum 18. September 2024 inne.
Veröffentlichungen
Europa u Hrvatskoj. Vodič kroz europske integracije na internetu, 2002, ISBN 953-7010-13-9