Loch Flodabay ist eine Bucht an der Ostküste von Harris, dem Südteil der Doppelinsel Lewis and Harris. Sie tritt aus der MeerengeThe Minch etwa zwei Kilometer in nordwestlicher Richtung in die Landmasse ein. Seeseitig begrenzend sind die etwa 1,8 Kilometer voneinander entfernt liegenden KapsRubha Quidnish im Südwesten und der Abschluss der Halbinsel Ard Manish im Nordosten. Südlich schließt sich die Bucht Loch Finsbay an, während Loch Geocrab die angrenzende Bucht im Norden ist.[2]
In Loch Flodabay liegen die etwa 190 Meter lange SchäreGlas Sgeir („Graue Schäre“) und die etwa 150 Meter lange Eilean Dubh („Schwarze Insel“) sowie verschiedene kleine Felsinseln. Insbesondere am Kopf der Bucht, nahe der WeilerFlodabay und Manish, den einzigen Siedlungen entlang der Küste von Loch Flodabay, münden mehrere kleine Bäche in Loch Flodabay.[2]