Die Liste der nigerianischen Hauptstädte behandelt alle Hauptstädte Nigerias und der Regionen und Bundesstaaten.
Unklar ist der Status des Bundesterritoriums (Federal Territory) um die Hauptstadt Lagos, ob es sich um einen Teil der Western Region oder um eine eigene Verwaltungseinheit handelt.
Während der Militärherrschaft vom 24. Mai bis 31. August 1966 wurden die Regionen zu Provinzen und das Bundesterritorium zum Hauptstadtterritorium (Capital Territory) erklärt.
Die östliche Region erklärte sich am 30. Mai 1967 unter dem Namen Biafra für unabhängig, was Nigeria nicht anerkannte. Es folgte der Biafra-Krieg, der 1970 mit der Kapitulation Biafras endete. Enugu war Hauptstadt von Biafra, war allerdings bereits ab Oktober 1967 unter der Kontrolle des nigerianischen Militärs, der Sitz von Verwaltung und Regierung wurde nach Umuahia und schließlich nach Owerri verlegt.
Das Bundesterritorium ist Teil des Bundesstaates Lagos.
Das Hauptstadtterritorium (Federal Capital Territory) um die Hauptstadt Abuja bildet eine selbstständige Verwaltungseinheit.