Nachdem er schon im Sommer 1945 zum Mitglied des erweiterten Oberkirchenrates berufen worden war, wählte ihn die Landessynode der Evangelischen Landeskirche in Baden Bender im November 1945 zum Landesbischof und damit zum Nachfolger von Julius Kühlewein, der kurz zuvor von seinem Amt zurückgetreten war. Im Februar 1946 trat er sein Amt an. Als Vertreter der Evangelischen Landeskirche in Baden war er von Januar bis Juni 1946 Abgeordneter der Vorläufigen Volksvertretung im Land Württemberg-Baden.
Nach Vollendung seines 71. Lebensjahrs trat Bender in den Ruhestand. Die Landessynode wählte daher im September 1964 Hans Heidland zu seinem Nachfolger. Ein gutes Jahr später verstarb Bender in Karlsruhe.
Dienende Kirche, FS für Landesbischof D. J. Bender zu seinem 70. Geburtstag, Im Namen des Oberkirchenrats der Evangelischen Landeskirche in Baden hg. von Otto Hof, Karlsruhe 1963.