Eine zweite Spezies, Ignisphaera cupida (mit Referenzstamm 4213-co), wurde in den heißen Quellen am Vulkan Uson auf der Halbinsel Kamtschatka gefunden.[6]
Der Referenzstamm AQ1.S1ᵀ der Typusart I. aggregans wurde aus einem Konsortium mit Pyrobaculum-Stäbchen kultiviert, das mit anderen von geothermischen Umgebungen in Neuseeland stammte.
Die Zellen dieses Stammes sind anaerobheterotroph. Sie sind in ihrer Morphologie regelmäßig bis unregelmäßig kokkenförmig (kokkoid) und bilden gelegentlich große Aggregate, insbesondere wenn Polysaccharide wie Konjak-Glucomannan als Kohlenstoffquelle verwendet werden. Die Wachstumstemperatur des Stamms liegt zwischen 85 und 98 °C (optimal bei 92–95 °C).
Diese Mikroben sind moderat acidophil (säureliebend oder -tolerant), Wachstum erfolgt im pH-Bereich von 5,4 bis 7,0 (optimal 6,4). Das Wachstum wird bei der Zugabe von Schwefel und Natriumchlorid (NaCl) gehemmt (optimales ohne Zugabe von NaCl). Ein Elektronenakzeptor ist nicht erforderlich. Der Stamm nutzt Stärke, Trypticase-Pepton,[7]Laktose, Glukose, Konjak-Glucomannan, Mannose, Galaktose, Maltose, Glykogen und β-Cyclodextrin als Kohlenstoffquellen. Der G+C-Gehalt beträgt 52,9 mol%. Aufgrund der 16S-rRNA-Gensequenzanalyse und der physiologischen Merkmale wurde der Stamm einer neuen Spezies einer neuen Gattung innerhalb der Thermoproteota („Crenarchaeota“) mit Namen Ignisphaera aggregans zugeordnet.[3]
Der erste Stamm (bzw. das erste MAG) ist Typusstamm (englischtype strain) für die jeweilige Spezies.
Namensherkunft
Der Gattungsname Ignisphaera leitet sich ab von lateinischignis‚Feuer‘ und altgriechischσφαῖραsphaîra, deutsch ‚Ball‘, ‚Sphäre‘; der neulat. Gattungsname bedeutet also ‚Feuerball‘.[1]
Das Art-Epithetonaggregans ist ein lateinischesAdjektiv mit der Bedeutung ‚Aggregate bildend‘, ‚zur Klumpenbildung neigend‘.[1]
Das Art-Epitheton cupida ist ein lateinisches fem. Adjektiv mit der Bedeutung ‚begehrend‘, ‚begehrlich‘, auch ‚begehrenswert‘[1]
Anwendungen
Endo-β-1,4-Galactanasen sind Glykosidhydrolasen (GH) aus der GH53-Familie, die zur größten Gruppe („Clan“) der GHs, dem Clan GH-A, gehören. Die biologische Vielfalt dieser Familie wurde 2021 von Sebastian J. Muderspach et al. im Jahr 2021 untersucht, insbesondere im Hinblick auf hyperthermostabile Endo-β-1,4-Galactanase von Ignisphaera aggregans (IaGal). Dies ist die erste GH53-Galactanase hyperthermophiler Archaeen und eignet sich als Ausgangsform oder Gerüst für die Entwicklung von thermostabilen Enzymen mit unterschiedlichen Eigenschaften im Detail.[9]
Bildergalerie: Endo-β-1,4-Galactanasen von I. aggregans im Vergleich mit anderen…
Übersicht über die Struktur der Endo-β-1,4-Galactanase von I. aggregans (IaGal)
Hochkonservierter Bereich mit π–π-Wechselwirkungen in Glykosidhydrolase-53 (GH53) Galactanasen.
Anmerkungen
↑bis auf die Metagenomik-Spezies AG1 sp003116855 syn. Ignisphaera sp. ILS 400,[2] die der Familie f__AG1 derselben Ordnung Sulfolobales zugeordnet wird
Weiterführende Literatur
Siegfried Burggraf, Harald Huber, Karl O. Stetter: Reclassification of the crenarchael orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data. In: International Journal of Systematic Bacteriology. 47. Jahrgang, Nr.3, 1. Juli 1997, S.657–660, doi:10.1099/00207713-47-3-657, PMID 9226896 (englisch).
Chris S. Knappy, Charlotte E. M. Nunn, Hugh W. Morgan, Brendan J. Keely: The major lipid cores of the archaeon Ignisphaera aggregans: implications for the phylogeny and biosynthesis of glycerol monoalkyl glycerol tetraether isoprenoid lipids. In: Extremophiles, Band 15, Nr. 4, Juli 2011, S. 517–528; doi:10.1007/s00792-011-0382-3, PMID 21630026 (englisch).
↑ abcd
Thomas D. Niederberger, Dorothee K. Götz, Ian R. McDonald, Ron S. Ronimus, Hugh W. Morgan: Ignisphaera aggregans gen. nov., sp. nov., a novel hyperthermophilic crenarchaeote isolated from hot springs in Rotorua and Tokaanu, New Zealand. In: Interntional Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 56, Nr. 5, 1. Mai 2006, S. 965–971; doi:10.1099/ijs.0.63899-0, PMID 16627639 (englisch).
↑ ab
Markus Göker, Brittany Held, Alla Lapidus, Matt Nolan, Stefan Spring, Montri Yasawong, Susan Lucas, Tijana Glavina Del Rio, Hope Tice, Jan-Fang Cheng, Lynne Goodwin, Roxanne Tapia, Sam Pitluck, Konstantinos Liolios, Natalia Ivanova, Konstantinos Mavromatis, Natalia Mikhailova, Amrita Pati, Amy Chen, Krishna Palaniappan, Evelyne Brambilla, Miriam Land, Loren Hauser, Yun-Juan Chang, Hans-Peter Klenk et al.: Complete genome sequence of Ignisphaera aggregans type strain (AQ1.S1T). In: Standards in Genomic Sciences, Band 3, Nr. 1, 30. August 2010, ISSN 1944-3277, S. 66–75; doi:10.4056/sigs.1072907, PMC 3035270 (freier Volltext), PMID 21304693, PDF (escholarship.org, englisch).
↑ abcd
Olga A. Podosokorskaya, Alexander G. Elcheninov, Alexandra A. Klyukina, Alexander Y. Merkel: Ignisphaera cupida sp. nov., a hyperthermophilic hydrolytic archaeon from a hot spring of Uzon (Kamchatka), and emended description of the genus Ignisphaera. In: Systematic and Applied Microbiology, Band 47, Nr. 5, September 2024, S. 126541; doi:10.1016/j.syapm.2024.126541, PMID 39084153 (englisch).
↑ ab
Zheng-Shuang Hua, Yu-Lin Wang, Paul N. Evans, Yan-Ni Qu, Kian Mau Goh, Yang-Zhi Rao, Yan-Ling Qi, Yu-Xian Li, Min-Jun Huang, Jian-Yu Jiao, Ya-Ting Chen, Yan-Ping Mao, Wen-Sheng Shu, Wael Hozzein, Brian P. Hedlund, Gene W. Tyson, Tong Zhang, Wen-Jun Li: Insights into the ecological roles and evolution of methyl-coenzyme M reductase-containing hot spring Archaea. In: Nature Communications. 10. Jahrgang, Nr.1, 8. Oktober 2019, ISSN2041-1723, QUT:PDF, S.4574, doi:10.1038/s41467-019-12574-y, PMID 31594929, PMC 6783470 (freier Volltext) – (englisch). Siehe insbes. Fig. 1 ③.
↑
Sebastian J. Muderspach, Folmer Fredslund, Verena Volf, Jens-Christian Navarro Poulsen, Thomas H. Blicher, Mads Hartvig Clausen, Kim Krighaar Rasmussen, Kristian B. R. M. Krogh, Kenneth Jensen, Leila Lo Leggio: Engineering the substrate binding site of the hyperthermostable archaeal endo-β-1,4-galactanase from Ignisphaera aggregans. In: Biotechnology for Biofuels, Band 14, 16. September 2021, S. 183; doi:10.1186/s13068-021-02025-6 (englisch).
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