Die Saison 2003/04 der Handball-Regionalliga Süd war die vierunddreißigste Spielzeit, welche unter dem Dach des Süddeutschen Handballverbandes (SHV) organisiert wurde und nach der Bundesliga, und der 2. Bundesliga zu den dritthöchsten Spielklassen im deutschen Handball gehörte.
Die HG Oftersheim/Schwetzingen wurde Meister und stieg in die 2. Bundesliga auf. Drei Absteiger mussten den Weg in die Oberligen antreten.
Nicht mehr dabei waren der Auf- und die Absteiger der Vorsaison. Neu hinzu kamen der Absteiger (A) aus der 2. Bundesliga und die Aufsteiger (N) aus den Oberligen Baden-Württemberg und der Bayernliga.
Der VfB Forchheim wechselte in die Regionalliga Mitte.. (N) = neu in der Liga, (A) = Absteiger aus der 2. Bundesliga Meister und Aufsteiger in die 2. Bundesliga. „Für die Regionalliga Süd 2004/05 qualifiziert“ Absteiger in die Bayernliga 2004/05 Absteiger in die Oberliga BW
Endrundenturniere (Männer) des SHV vor Einführung der Handball-Bundesliga zur Saison 1966/67 1950 | 1951 | 1952 | 1953 | 1954 | 1955 | 1956 | 1957 | 1958 | 1959 | 1960 | 1961 | 1962 | 1963 | 1964 | 1965 | 1966
Endrundenturniere (Männer) des SHV nach Einführung der Handball-Bundesliga 1967 | 1968 | 1969
Handball-Regionalliga Süd des SHV als zweithöchste Spielklasse 1969/70 | 1970/71 | 1971/72 | 1972/73 | 1973/74 | 1974/75 | 1975/76 | 1976/77 | 1977/78 | 1978/79 | 1979/80 | 1980/81
Handball-Regionalliga Süd ab 1981/82 als dritthöchste Spielklasse 1981/82 | 1982/83 | 1983/84 | 1984/85 | 1985/86 | 1986/87 | 1987/88 | 1988/89 | 1989/90 | 1990/91 | 1991/92 | 1992/93 | 1993/94 | 1994/95 | 1995/96 | 1996/97 | 1997/98 | 1998/99 | 1999/2000 | 2000/01 | 2001/02 | 2002/03 | 2003/04 | 2004/05 | 2005/06 | 2006/07 | 2007/08 | 2008/09 | 2009/10