1927 heiratete sie den Dirigenten Hermann Scherchen, von dem sie allerdings nach kurzer Zeit wieder geschieden wurde. Vorangegangen waren verschiedene Affären, unter anderem mit Carl Zuckmayer, der sie aufgrund ihrer vitalen Erscheinung als litauische Wölfin bezeichnete. In zweiter Ehe heiratete Müller 1931 den damaligen Oberbürgermeister von Königsberg, Hans Lohmeyer. Nach 1933 hatte sie aufgrund ihrer Ehe mit Lohmeyer, der durch die Nationalsozialisten seines Amtes enthoben wurde, an deutschen Bühnen einen schweren Stand und zog sich – auch aufgrund eines schweren Lungenleidens – weitgehend ins Privatleben zurück. 1945 trat sie allerdings bei der Wiedereröffnung des Deutschen Theaters erneut auf, bis zu ihrem Tod spielte sie wieder und lehrte zudem an der Hochschule für Schauspiel. Kurz vor ihrem Tod erhielt sie 1951 für ihre Darstellung der Brecht’schen Mutter Courage den Nationalpreis der DDR.