Der Europapokal der Pokalsieger 1979/80 war die 20. Ausspielung des Wettbewerbs der europäischen Fußball-Pokalsieger. 34 Klubmannschaften aus 33 Ländern nahmen teil, darunter Titelverteidiger FC Barcelona, 26 nationale Pokalsieger und 7 unterlegene Pokalfinalisten (Waterford FC, Aris Bonneweg, BSC Young Boys, Dynamo Moskau, Beroe Stara Sagora, FC Twente Enschede und AFC Wrexham). Wrexham trat als Finalist des Welsh Cup 1979 an, da es sich beim Sieger Shrewsbury Town um eine englische Mannschaft aus der Grenzregion handelte. Damit waren bis auf Liechtenstein, dass noch nie am Wettbewerb beteiligt war, nach Jahren erstmals wieder alle europäischen Landesverbände vertreten.
Das Finale bestritten der FC Valencia und der FC Arsenal im Heysel-Stadion von Brüssel am 14. Mai 1980. Valencia gewann das Spiel mit 5:4 nach Elfmeterschießen, nachdem in 120 Minuten Spielzeit kein Treffer gefallen war.
Torschützenkönig wurde der Argentinier Mario Kempes vom FC Valencia mit 9 Toren.
Die Teilnehmer spielten wie gehabt im reinen Pokalmodus mit Hin- und Rückspielen den Sieger aus. Gab es nach beiden Partien Torgleichstand, entschied die Anzahl der auswärts erzielten Tore (Auswärtstorregel). War auch deren Anzahl gleich fand im Rückspiel eine Verlängerung statt, in der auch die Auswärtstorregel galt. Herrschte nach Ende der Verlängerung immer noch Gleichstand, wurde ein Elfmeterschießen durchgeführt. Das Finale wurde in einem Spiel auf neutralem Platz entschieden. Bei unentschiedenem Spielstand nach Verlängerung wäre der Sieger ebenfalls in einem Elfmeterschießen ermittelt worden.
Vorrunde
Die Hinspiele fanden am 15./21. August, die Rückspiele am 8. September 1979 statt.