Abbühl war ab 1992 Solo-Oboist des Basler Sinfonieorchesters, ab 1997 Solo-Oboist beim Rotterdams Philharmonisch Orkest und wechselte 2006 an die gleiche Position beim London Symphony Orchestra.[1] Seit 1994 spielt er als Gastsolist beim Chamber Orchestre of Europe.
Emanuel Abbühl unterrichtete seit 1988 am Rotterdams Conservatorium, 2005 wurde er Professor an der Staatlichen Hochschule für Musik in Mannheim sowie Professor an der Hochschule für Musik Basel.[2]
Meisterkurse betreute er in Japan, Korea, Paris (CNSM), Deutschland, Spanien, in Melbourne (Australian National Academy), Mexico (Universidad Nacional), London (Royal Academy), Manchester (Northern College).
