Innerhalb der belgischen Bischofskonferenz gibt es vier ständige bischöfliche Kommissionen und drei bischöfliche Komitees. Ihnen steht jeweils ein Bischof vor, zu Mitgliedern werden jeweils zwei bis drei Bischöfe gewählt, als weitere Mitglieder können Geistliche und Sachverständige aufgenommen werden. Des Weiteren verfügt die Bischofskonferenz über ein Koordinationskomitee. In ihm werden die Arbeiten für die Kommissionen und Komitees vorbereitet, des Weiteren werden auch interdiözesane Projekte beraten. Dieses Komitee wird vom Vorsitzenden der Bischofskonferenz geleitet.