Wafy arbeitete von 1981 bis 1985 in verschiedenen leitenden Funktionen bei der nigrischen Polizei, etwa als Direktor der nationalen Polizeischule und als Verwaltungs- und Finanzdirektor. Anschließend war er zehn Jahre lang als Manager in der Wirtschaft tätig. Staatspräsident Ibrahim Baré Maïnassara bestimmte ihn 1997 zu seinem Sicherheitsberater.
Nach dem Sturz Baré Maïnassaras wurde Abdallah Wafy ins Ausland geschickt. So wirkte er von 1999 bis 2003 als Botschafter Nigers in Libyen und zugleich als ständiger Vertreter Nigers bei der Gemeinschaft der Sahel-Sahara-Staaten. Nachdem er in Niger unter anderem ein Projekt zu computergestützten Personalausweisen koordiniert hatte, stand Wafy von 2006 bis 2007 im Dienst der Zivilpolizei der Operation der Vereinten Nationen in Côte d’Ivoire (ONUCI). Danach war er Präsident der Disziplinarkommission der Polizei Nigers und zugleich Berater von Innenminister Albadé Abouba für Sicherheits- und Dezentralisierungsfragen.