F.C. Københavns sæson 2006/2007 er klubbens 15. sæson i Superligaen. Sæsonen vil blive husket som den sæson klubben kvalificerede sig til gruppespillet i Champions League for første gang.
Brøndby IF mod Viborg FF blev 1-1. Brøndby IF vinder (2-1), FC København bliver nr. 2 (2-2) og Viborg FF nr. 3 (2-3).
Kampe
Stillingen
Grøn kvalificerer sig til kvartfinalen i Royal League
Slutstilling Pulje F
Grøn kvalificerer sig til 2. runde i UEFA Champions League Blå kvalificerer sig til 3. runde i UEFA Cup