Valencia spillede desuden, mellem 1992 og 1998, 37 kampe og scorede 14 mål for det colombianske landshold.[2] Han repræsenterede sit land ved både VM i 1994 i USA[3] og VM i 1998 i Frankrig.[4] Han spillede ved begge turneringer alle sit holds tre kampe. Han var også med til at vinde bronze ved Copa América i 1993.