Zdrojem vody jsou především dešťovésrážky. Nejvyšších vodních stavů dosahuje od listopadu do března. V létě nakrátko voda opadá. Průměrný průtok vody v Paříži činí přibližně 250 m³/s a poblíž ústí 450 až 500 m³/s, maximální pak až 8000 m³/s. Vliv přílivu se projevuje až do vzdálenosti 35 km nad město Rouen, kde tomu je přizpůsobena kanalizační síť. Velikost přílivu činí v Le Havre 7,5 m a v Rouenu 2 m. Během silných povodní je zaplavovaná okolní krajina, přičemž zaplaveníPaříže zabraňují hydrotechnická díla na řece a jejich přítocích nad městem.
Využití
Vodní doprava
Řeka je hlavní dopravní tepnou Francie. Vodní doprava je možná až do města Troyes. V horní části bočním kanálem a od ústí Aube níže už přímo po řece. Do ústí řeky lodě z důvodu vysokých přílivů vplouvají přes Tancarvilleský kanál. Námořní lodě s ponorem do 6,5 m mohou plout do vzdálenosti 120 km od moře do Rouenu, dále do Paříže s ponorem do 3,2 m a výše s ponorem do 1,3 m. Hlavní přístavy na řece jsou již jmenované Paříž, Rouen a Le Havre. Řeka je významnou vodní cestou spojující Pařížskou aglomeraci nejen s mořem ale pomocí vodních kanálů i s dalšími řekami (Somma, Šelda, Máza, Rýn, Saôna, Loira). Do roku 2025 má být vybudována velkokapacitní vodní cesta Seina – severní Evropa, která řeku napojí na síť evropských vodních cest.
