V roce 2011 musel podstoupit nutnou operaci nádoru na játrech. Operace se zdařila a Abidal už po půl roce mohl nastoupit do finále Ligy mistrů, kde mu symbolicky kapitán Carles Puyol předal pásku, aby Abidal byl prvním, kdo zvedl pohár nad hlavu. Začátkem roku 2012 se ale u něj opět objevily komplikace a musel mu být voperován nový kus jater, který mu daroval jeho bratranec. Dne 6. dubna 2013 se Abidal vrátil na fotbalový trávník v Barceloně. Nastoupil v 70. minutě do zápasu proti RCD Mallorca.
Dne 29. května 2013 na tiskové konferenci oznámil, že mu klub neprodlouží smlouvu a že tedy v Barceloně končí. Staronové angažmá našel v AS Monaco. V červenci 2014 odešel do řeckého klubu Olympiakos Pireus.[1]
V prosinci 2014 oznámil ve věku 35 let ukončení profesionální kariéry.[2] V roce 2018 se stal sportovním ředitelem FC Barcelona.