Aquesta és la llista dels governadores de Guajuato. L'Estat Lliure i Sobirà de Guanajuato va ser creat en 1824 i és un dels estats originals de la federació mexicana, per la qual cosa al llarg de la seva vida històrica ha passat per tots els sistemes de govern vigents a Mèxic, tant el sistema federal com el sistema central, per la qual cosa la denominació de l'entitat ha variat entre estat i departament; variant juntament amb ella, la denominació del titular del Poder Executiu de l'Estat.
Governadors de l'Estat Lliure i Sobirà de Guanajuato