En un principi, i condicionat per una disposició legal, el president Antich només va poder nomenar 10 consellers amb cartera —6 del PSOE, 2 del PSM, 1 d'EU i 1 d'Els Verds—, a banda d'un vicepresident, Pere Sampol, i dos consellers sense cartera —1 del PSOE i 1 d'EU.[1]
Dia 16 de març de 2000, i després d'aprovar-se una llei[2] que permetia el president de decidir lliurement el nombre de conselleries que formarien el gabinet autonòmic. Llavors, l'executiu balear va quedar format per 7 consellers del PSOE, 3 del PSM, 2 d'EU i 1 d'Els Verds.
Al BOIB 520 de 28 de juliol de 1999[4] se va definir les estructures de cada conselleria a través de diferents decrets. Pel que fa a nomenaments és produí a través de diversos butlletins oficials de diferents dates: 521,[5] 522,[6] 523,[7] 101,[8] 105,[9] 524,[10] 131.[11] 10.[12]
Conselleria de Presidència
Secretaria General Tècnica: Fernando Pozuelo Mayordomo
Direcció General de Presidència: Damià Jaume Cánoves Rotger / Pere Fullana Puigserver (des de desembre de 2000)
Direcció General de Relacions Institucionals: Pere Fullana Puigserver / Antoni Reinés Pons (des de desembre de 2000)
Direcció General de Relacions amb el Parlament i de Coordinació Normativa: Valentí Valenciano López
Direcció General de Patrimoni i Entitats Jurídiques: Antoni Garcías Simó
Direcció General de Comunicació: Jordi Bayona Llopis
Gabinet Tècnic del President: María Rosselló Martorell
Director de l'Institut de Relacions Europees: Damià Pons i Pons (fins a febrer de 2000)[13]
Direcció general de Relacions Europees i per a la Mediterrània: Juan Manuel López Nadal
Delegació del Govern de les Illes Balears a Brussel·les: Antoni Costa Costa
Conselleria d’Hisenda, Pressuposts, Energia i Innovació Tecnològica
Secretaria General Tècnica: Pablo Rivero Corte
Intervenció General: Vicente Ligüerre Gil
Tresoreria General: José Luís Gil Martín
Direcció General de Pressuposts: Cristòfol Milán Mateu
Direcció General d’Hisenda.
Direcció General de Programació i Ordenació Econòmica: Tomás Méndez Reyes
Direcció General de Tecnologia i Comunicacions: Carles Bona García
Direcció General d’Energia: Juan Perchés Escandell
Direcció General de Recaptació i de Coordinació amb les Hisendes Territorials: Joaquín Tomás Estrada
Conselleria de Treball i Benestar Social
Secretaria General Tècnica: Agustín Aguirrebengoa Esnaola
Direcció General de Treball: Fernando Galán Guerrero
Direcció General de Formació: Francesc Obrador Moratinos
Direcció General de Salut Laboral: Aina Vicens Llodrà
Direcció General de Joventut: Joan Caules Ameller
Direcció General d’Esports: Joana Maria Petrus Bey
Direcció General de Cooperació: Assumpta Gorrías Pons
Direcció General de Serveis Socials: Antoni Sancho Cervantes
Delegat territorial d'Educació a Eivissa i Formentera: Antoni Marí Marí
Conselleria de Sanitat i Consum
Secretaria General Tècnica: Gabriel Payeras Muntaner
Direcció General de Sanitat: Josep Manuel Pomar Reynes
Direcció General de Consum: Miguel Ángel Cabeza Rodríguez
Director gerent del Servei Balear de la Salut: Adolfo Marques Bravo / Joan Domènech Ticó (des de 14 d'abril de 2000) / Julio Fuster Culebras (des de 8 de juny de 2001)
Conselleria de Medi Ambient
Secretaria General Tècnica: Joana Coloma Busquets Huguet / Joana Aina Campomar Orell (des de 1 de febrer de 2001)
Direcció General de Biodiversitat: Pere Tomas Vives / José Manuel Gómez González (des de 1 de març de 2000)[14]
Direcció General de Residus i Energies Renovables: Nicolau Jaume Barceló Montserrat
Direcció General de Recursos Hídrics: Antonio Rodríguez Perea
Direcció General de Litoral i Territori: Onofre Rullán Salamanca
Direcció General de Mobilitat i Educació Ambiental: Salvador Miralles Valero
Conselleria d’Economia, Agricultura, Comerç i Indústria
Secretaria General Tècnica: Sebastià Rechach Genovard
Direcció General d’Economia: Antoni Monserrat Moll
Direcció General d’Agricultura: Margalida Estelrich Font
Direcció General d’Infraestructures Agràries: Mateu Ginard Sampol
Secretaria General Tècnica: Ramón Ignacio Morey Aguirre
Direcció General de Tecnologia i Comunicacions
Direcció General d’Energia
Direcció General de Recerca, Desenvolupament Tecnològic i Innovació
Reorganització Conselleria de Salut
El traspàs de les funcions i serveis de l’INSALUD a les Illes Balears feren necessària una reorganització de la Conselleria. Per altra banda, es volgué tenir en compte la necessitat de donar una atenció preferent a la prestació farmacèutica. I a més, la Conselleria de Sanitat i Consum passa a denominar-se Conselleria de Salut i Consum, atès que molts organismes supraautonòmics adaptaren la nomenclatura de Salut en lloc de Sanitat.[16]
Conselleria de Salut i Consum
Secretaria General Tècnica
Direcció General de Salut Pública i Participació: Margalida Buades Feliu
Direcció General de Planificació i Finançament: Pablo Rivero Corte
