Podzemna stabiljka je crepasta lukovica iz koje izlazi izdanak s pojedinačnim cvjetovima u štitastom cvatu. Naraste u visinu 50–100 cm. Boje ljiljana su: bijela, žuta, ružičasta, narandžasta i crvena. Plod je tobolac s 500 sjemenki. Cvjetovi su krupni, ljevkasti ili zvonoliki. Listići cvijeća su srasli ili djelomično slobodni, više ili manje savijeni unatrag.[1]
Listovi su linearni, lancetasti, ovalni na stapkama ili sjedeći. Na gornjem dijelu peteljke nema listova.
U Bosni i Hercegovini i ostalim balkanskim zemljama, ljuljani su samonikli i predstavljeni sa četiri vrsta. Planinski ili lukovičasti ljiljan (Lilium bulbiferum) raste na planinskim livadama i proplancima. Ima uspravne ili stršeće narandžaste do crvenonarandžaste cvjetove. Kranjski ljiljan (Lilium carniolicum), ima viseće žute do naranđžaste cvjetove, nastanjuje gorske travnjake i svijetle šume i šikare. U šumama raste i zlatni ljiljan (Lilium martagon), s listovima u pršljenu na sredini stabljike. Njegovi mesnatocrveni listići ocvijeća savijeni su unatrag, a na unutrašnjoj strani imaju tamnije pjege. Sve su te tri vrste zakonom zaštićene. Bosanski ljiljan (Lilium bosniacum) je endemska biljka planinskih travnjaka Dinarskih planina.
Od davnina se kao ukrasna biljka uzgaja bijeli, gospin ili marijin ljiljan (Lilium candidum), porijrklom s jugoistoka Balkana, iz Libana i Izraela.
Po obliku cvijeta ljiljani se dijele na dvije skupine:
1. Sekcija:
trubasti cvjetovi ljevkastog oblika zašiljenih ili zaobljenih latica.
skupina martagon - cvjetovi su viseći s unatrag savijenim cvjetnim laticama. Ima 6 prašnika na dugačkim drškama izvan cvijeta. Cvjetovi su u grozdu od 3-12 cvjetova.
2. Sekcija: uključuje ostale karakteristike u 7 odjela:
Azijski ljiljani su snažne biljke krupnih cvjetova i često jarkih boja. Cvjetovi su uspravni, u svim tonovima. Rasprostranjeni su na svim tlima.
Turbanoliki ili turkoliki ljiljani
Lilium martagon naraste do 150 cm. Cvjetovi su ružičasti, dolaze u grozdovima 30-40 komada. Latice su uvijene unazad, u obliku turbana. Listovi su krupni. Cvjeta u junu i julu, a miris mu je težak i neugodan.
Lilium longiflorum naraste do oko 90 cm. Cvijet može biti dug 13–18 cm, bijele je boje, na jednoj dršci nalazi se nekoliko cvjetova turbanastog oblika. Neotporan je na hladnoću.
Lilium regaleili kraljevski ljiljan: cvjetovi su krupni i ugodnog mirisa, u punom cvatu imaju i do 30 cvjetova. Visina doseže 100 cm, cvjetovi hibrida su srebrnobijeli, žuti, zlatnožuti, ružičasti, iznutra bijeli, a izvana grimizno nijansirani.
Američke vrste i hibridi
Ovakvi hibridi rastu od oko 150–180 cm. Imaju i do 25 žutih, narandžastih i crvenih cvjetova sa smeđim ili crnim pjegama.
Orijentalne vrste i hibridi
To su svi hibridi nastali ukrštanjem vrsta koje potječu iz Japana: zlatni ljiljan, japanski ljiljan i niski ljiljan.
^Pelkonen, Veli-Pekka; Pirttilä, Anna-Maria (2012). "Taxonomy and Phylogeny of the Genus Lilium"(PDF). Floriculture and Ornamental Biotechnology. 6 (Special Issue 2): 1–8. Pristupljeno 29. 7. 2016.