Osnovano je 1883, kada je za muftiju postavljen Sabit Ribić. Nakon imenovan je Sulejman Šarac, u periodu od 1885. do 1887. godine. Svečano je imenovan za reis-ul-ulemu 26. juna 1910. Jusuf Jahić je obnašao funkciju bihaćkog muftije 14 godina, do 1914. U periodu od 1914. do 1921. mjesto muftije je bilo upražnjeno, ali je 1921. imenovan na dužnost muftije Abdulah Moranjak, da bi Muftijstvo bihaćko 1930. godine bilo ukinuto. Muftijstvo je 1993. obnovljeno i na čelu te institucije je postavljen Hasan Makić, koji je tu dužnost obavljao do 2019. godine.