София Августа фон Шлезвиг-Холщайн-Готорп (на немски: Sophie Auguste von Schleswig-Holstein-Gottorf; * 5 декември 1630 в Готорп, † 12 декември 1680 в Косвиг, Анхалт) от род Олденбург е принцеса от Шлезвиг-Холщайн-Готорп и чрез женитба княгина на Анхалт-Цербст.[1]
Тя е най-възрастната дъщеря на херцог Фридрих III фон Шлезвиг-Холщайн-Готорп (1597 – 1659) и Мария Елизабет Саксонска (1610 – 1684), дъщеря на курфюрст Йохан Георг I от Саксония. Сестра ѝ Хедвиг Елеонора (1636 – 1715) се омъжва през 1654 г. за по-късния крал Карл X Густав от Швеция.[2]
София Августа се омъжва на 16 септември 1649 г. в дворец Готорп за княз Йохан VI фон Анхалт-Цербст (1621 – 1667) от род Аскани.[3]
Йохан умира през 1667 г. от детска шарка на 46 години. Магдалена поема опекунството на първородения ѝ син заедно с ландграф Лудвиг VI фон Хесен-Дармщат и княз Йохан Георг II от Анхалт-Десау.
София Августа и Йохан фон Анхалт-Цербст имат децата:[4]