Елизабет Шарлота се омъжва на 24 юли 1616 г. в Хайделберг за Георг Вилхелм фон Бранденбург (1595 – 1640) от фамилията Хоенцолерн, който става през 1619 г. курфюрст и маркграф на Бранденбург и херцог на Прусия. През август 1638 г. Георг Вилхелм с целия си двор се мести в Кьонигсберг в неразрушеното Херцогство Прусия. Той умира след дълго боледуване на 45-годишна възраст.
Последните си години като вдовица тя прекарва в резиденцията си в Кросен на Одер, където умира на 26 април (16 април по стар стил) 1660 г. Днес гробът ѝ се намира в гробницата на Хоенцолерните в Берлинската катедрала.
Ernst Daniel Martin Kirchner: Die Kurfürstinnen und Königinnen auf dem Throne der Hohenzollern, 2. Teil: Die letzten acht Kurfürstinnen, Berlin 1867, S. 182 – 220 Портрет на Елизабет Шарлота от Пфалц