Adhyatma pernah menjadi Dokabu (Kepala Kandepkes) di Jawa Tengah dan mengelola Rumah Sakit Kusta Sitanala, Tangerang. Ia dikenal sebagai pejabat struktural karier di Ditjen P2MPLP (Pemberantasan Penyakit Menular dan Penyehatan Lingkungan Pemukiman) Departemen Kesehatan. Sebelum menjadi Dirjen P2MPLP, ia menjabat Kepala Direktorat Pemberantasan Penyakit Bersumber Binatang, serta Dirjen P3M (Pemberantasan Penyakit Menular), nama lama P2MPLP.
Ia memegang jabatan dirjen untuk dua periode, walaupun masa jabatan kedua belum dirampungkannya, ketika ia meletakkan jabatan tanggal 6 Maret1987 untuk memegang jabatan di UNICEF yang berkedudukan di Bangkok.
Walau demikian, yang jelas berita tersebut disambut gembira oleh kalangan Departemen Kesehatan, karena pada waktu itu beliau bukanlah "orang luar" bagi departemen yang akan dipimpinnya itu. Jujur, sederhana, alim, tekun, suka tantangan, dan tanggungjawab itulah sebagian predikat yang bertubi-tubi diberikan oleh kalangan Depkes, baik anak buahnya maupun rekan-rekannya dulu, untuk menggambarkan karakter beliau ini.