在1999年,自慰馬拉松由经营震得好(英语:Good Vibrations (sex shop))的集體開放企業(collective Open Enterprises)舉辦。其口號「為了一個原因而來」(Come for a Cause)由成人用品店Babeland的創始人雷切爾·維寧(Rachel Venning)杜撰,其在西雅圖、布鲁克林区、曼克頓都有分公司。自慰馬拉松由震得好所創,其鼓勵其他現代性玩具企業每逢「自慰月」時(美國的5月)去舉行活動。在那一年,首次現場活動由性別與文化研究中心(英语:Center_for_Sex_&_Culture)(Center for Sex and Culture)的卡羅爾·奎恩(Carol Queen)及她的伙伴羅伯特·勞倫斯(Robert Lawrence)在舊金山的校園劇院舉行。性別與文化研究中心是專業非盈利的性教育機構。一年一度的自慰馬拉松被用以作公眾健康教育的平台,增加對自体性行为的了解,並是推廣更安全更健康的性活動及自愛的去污名化策略。