第二次鸦片战争以英国胜利告终后,清政府被迫向柯拜家族支付12万银元作为赔偿,1861年柯拜之子约翰·卡杜·柯拜便利用这笔赔款建立了J.C.Couper & Co.,将船坞扩建为4座,其中1座於1862年建成,位於現黃埔造船廠內,東征陣亡烈士紀念坊西側約20米處,塢長167.64米、塢口寬為24.38米、深5.19米,四周用花崗石砌成。塢的兩邊層疊著一級級石階梯,塢口向著新洲河道,為正北方向。此塢有兩道浮門,分內外兩區,可供兩艘中、小型船隻同時入塢,或一艘5000噸的輪船入塢修理。這個船塢在19世紀60年代被稱為「中國最大的石船塢」。1863年,约翰·卡杜·柯拜将船坞出售给怡和洋行等財團,成為香港黄埔船坞公司(The Hong Kong and Whampoa Dock Company Limited)的資產,及後香港黄埔船坞公司出售船坞予兩廣總督劉坤一,集中發展香港船坞。香港黃埔船塢英文名中的「Whampoa」,正是廣州黃埔的傳統英文譯名。