哥打巴托市(英语:Cotabato City , 爪夷文: كوتا نو كوتاواتو 他加祿語:Lungsod ng Cotabato)是菲律宾棉兰老岛的一个城市,行政區劃上属于SOCCSKSARGEN大区马京达瑙省的飞地;原先是棉兰老穆斯林自治区政府的所在地,卻不是棉兰老穆斯林自治区的一部份,直到2019年時通過公投加入邦薩摩洛自治區[1],西面为莫罗湾。建立于1520年,下辖37个镇。该城的基督徒和穆斯林时常发生武装冲突。