Theo thể thức bốc thăm vòng 16 đội, 8 đội đứng đầu sẽ đá tại sân của đội đứng thứ nhì tại trận lượt đi và đội đứng đầu mỗi bảng sẽ đá ở sân nhà tại trận lượt về. Các đội cùng quốc gia hoặc cùng bảng sẽ không được gặp nhau.
Kể từ tứ kết trở về sau, các đội cùng quốc gia hoặc cùng bảng sẽ có thể gặp nhau.
Lượt bốc thăm được tổ chức vào ngày 12 tháng 12 năm 2016.[5] Lượt đi được thi đấu vào 14, 15, 21 và 22 tháng 2, và lượt về sẽ được thi đấu vào ngày 7, 8, 14 và 15 tháng 3 năm 2017.
Lượt bốc thăm sẽ vào ngày 17 tháng 3 năm 2017.[6] Lượt đi sẽ thi đấu vào ngày 11 and 12 tháng 4, và lượt về sẽ thi đấu vào ngày 18 và 19 tháng 4 năm 2017.
Lễ bốc thăm vòng bán kết sẽ được tổ chức vào ngày 21 tháng 4 năm 2017. Lượt đi sẽ chơi vào ngày 2 và 3 tháng 5, và lượt về sẽ chơi vào ngày 9 và 10 tháng 5 năm 2017.
Trận chung kết sẽ diễn ra vào ngảy 3 tháng 6 năm 2017 tại Sân vận động Thiên niên kỷ ở Cardiff, xứ Wales.[39] Đội "chủ nhà" (vì mục đích hành chính) sẽ được xác định bởi một lễ bốc thăm tổ chức trước đó là bốc thăm bán kết.
Lỗi chú thích: Đã tìm thấy thẻ <ref> với tên nhóm “note”, nhưng không tìm thấy thẻ tương ứng <references group="note"/> tương ứng, hoặc thẻ đóng </ref> bị thiếu