Санчес народився в Гвадалахарі та почав кар'єру в місцевому клубі з однойменною назвою. 20 березня 1994 року в матчі проти «Толуки» Хоель дебютував у мексиканській Прімері. У перших сезонах він отримував трохи ігрового часу і став гравцем основного складу лише у сезоні 1995/96. У 1997 році він виграв свій перший чемпіонат у складі «Чівас».
Влітку того ж року Хоель перейшов до «Америки», але протягом трьох сезонів так і не зміг до кінця адаптуватися в команді і в 2000 році повернувся в «Гвадалахару». У рідному клубі він провів три сезони і в кінці 2003 року перейшов в «Веракрус». 1 серпня 2004 року в матчі проти «Америки» Санчес дебютував за новий клуб. У тому ж році він перейшов в «Дорадос де Сіналоа», але вже влітку 2005 повернувся в «Веракрус».
У сезоні 2006/07 Хоель підписав контракт з клубом «Керетаро», в якому провів один сезон, після чого відправився в довгострокову оренду в «Естудіантес Текос» зі свого рідного міста. 4 серпня 2007 року в матчі проти «Пачуки» Санчес дебютував за новий клуб і в цьому ж поєдинку забив свій перший гол за команду. У 2010 році захисник повернувся в «Керетаро», але не встигнувши зіграти і матчу був знову відправлений в оренду у «Веракрус». 24 липня 2010 року в матчі проти «Універсідад Гвадалахара», він дебютував за клуб[1]. За сезон він взяв участь лише в 7 зустрічах і влітку 2011 року вирішив завершити кар'єру.
