Став бакалавром мистецтв в Орлеані, бакалавром математичних наук у Парижі, потім отримав ліцензію з фізичних наук. Але надалі стало зрозумілим, що подальшу кар'єру він може зробити лише в Парижі, куди 15 червня 1834 року він виїхав.
У 1839 році обійняв посаду завідувача кафедри геології та мінералогії в Тулузькому університеті, а наступного року — кафедру ботаніки та зоології в Університеті Ренна.
Він вивчав окрім інфузорій також форамініфери, яких вперше визначив як одноклітинні організми. У центрі цих організмів він спостеріг речовину, яка згодом отримає назву протоплазма. У 1835 році він спростував теорію, яка стверджувала, що мікроорганізми мають ті самі органи, що і багатоклітинні тварини.
Він також вивчав книдарій, голкошкірих і гельмінтів. Його дослідження з цих питань лягли в основу паразитології. Є відомим завдяки ідентифікації та першому опису в 1850 році тіл грибів (corpora pedunculata) у мозку перетинчастокрилих (бджілка, джміль, сфікса, мураха тощо) та мух Drosophila melanogaster. Він вперше заявив, що мозок є осередком інтелекту[5]. Пізніше це виявилося майже точним, оскільки ці структури нині розглядаються як місце пам'яті та багатьох інших видів поведінки у безхребетних.
1833. Flore complète d'Indre et Loire. Société d'agriculture, sciences, arts et belles-lettres du département d'Indre-et-Loire, Tours. / Повна флора Ендру та Луари
1837. Mémoire sur les couches du sol en Touraine et descriptions des coquilles de la craie des faluns / Шари ґрунту в Турені та описи крейдяних черепашок фалунів
1841. Histoire naturelle des zoophytes. Infusoires, comprenant la physiologie et la classification de ces animaux, et la manière de les étudier à l'aide du microscope / Природна історія зоофітів. Інфузорії, розуміння фізіології та класифікації цих тварин і способи їх вивчення за допомогою мікроскопа
1842. Nouveau manuel de l'observateur au microscope / Новий посібник дослідника з мікроскопом
1845. Histoire naturelle des helminthes ou vers intestinaux / Природна історія гельмінтів або кишкових глистів
1835-1845. Histoire naturelle des animaux sans vertèbres : présentant les caractères généraux et particuliers de ces animaux, leur distribution, leurs classes, leurs familles, leurs genres, et la citation des principales espèces qu s'y rapportent : précédée d'une introduction offrant la détermination des caractères essentiels de l'animal, sa distinction du végétal et des autres corps naturels, enfin, l'exposition des principes fondamentaux de la zoologie. Paris ; Londres : J.B. Baillière/ Природна історія тварин без хребта: представлення загальних та окремих характерів цих тварин, їх розподілу, їх класів, їх сімей, їх родів та цитування основних видів, що відносяться до них: передує вступ, що пропонує визначення основні характеристики тварини, її відмінність від рослин та інших природних тіл, нарешті, виклад основних принципів зоології
1850. Mémoire sur le système nerveux des Insectes, Ann Sci Nat Zool, 14 (1850), p. 95-206 / Записки про нервову систему комах
1850. Notice sur les travaux scientifiques de M. Félix Dujardin. Paris, impr. Martinet, 1850. Cote : 110133 vol. XXIII n° 25. / Повідомлення про наукову роботу Фелікса Дюардена
1862. Histoire naturelle des zoophytes échinodermes : comprenant la description des crinoïdes, des ophiurides, des astérides, des échinides et des holothurides. Paris : Librairie encyclopédique de Roret, / Природна історія зоофітів голкошкірих: включаючи опис криноїдів, офіуридів, астеридів, ехіноїдів та голотуридів.
1862. Histoire naturelle des Zoophytes Echinodermes. Paris. / Природна історія зоофітів Голкошкірих