Середній Рейн переходить у Нижній в Бонні, у тому місці, де у місці злиття із Зігом починається Північнонімецька низовина.
Нижній Рейн тече між відмітками 50 та 12 метрів н. р. м.
Найважливіші його притоки — Рур та Ліппе.
Як і Верхній, меандрований Нижній Рейн забраний у постійне річище під час проведених гідротехнічних робіт.
Однак оскільки на Нижньому Рейні дамби, що огороджують, розставлені ширше, у повінь він розливається більш просторо, ніж Верхній Рейн.
За 30 кілометрів нижче за течією біля Везеля від Рейну відгалужується канал Везель — Даттельн.
Цей судноплавний канал, що прямує із заходу на схід паралельно до течії річки Ліппе, є однією з найважливіших транспортних артерій.
Між Еммеріхом і Клеве над річкою завширшки понад 400 м натягнутий найдовший висячий міст[en] у Німеччині.
Майже відразу після перетину кордону з Нідерландами Рейн розпадається на численні рукави.
Основний рукав називається Вааль, який тече від Неймегену до Маасу; після чого він називається Мерведе[en].
Поблизу Роттердама річка відома як Ньїве-Маас і після злиття з Ауде-Маас має назву Схер[en] і далі через канал Ньїве-Ватервег[en], що впадає в Північне море біля Гук-ван-Голланд.
