Футбольна команда в Чорткові була утворена у 1946 році під назвою «Динамо».
Команда під назвою «Цукровик» у середині та наприкінці 1980-х брав участь у чемпіонаті України серед колективів фізкультури.
У 1990 році стала називатися «Кристал». Президентом футбольного клубу був Василь Караван і при його керівництві у 1992 році команда стартувала в першій лізі чемпіонату України, одразу ж посівши 6-е місце.
Проте найуспішнішим для команди став сезон 1995-96 р., коли під орудою Семена Осиновського команда демонструвала змістовну і результативну гру (70 м'ячів у 42 іграх), хоча в чемпіонаті посіла лише 10-те місце, тоді ж у 1996 році виграла Кубок Підгір'я.
Через рік у сезоні 1996-1997 команда зайняла останнє 24 місце серед команд першої ліги й опустилась у другу лігу, в якій найкращим результатом був сезон 1997-1998 та 5-те місце серед 18-ти команд.
З 1999 року команда під назвою «Авіаносець» виступала в чемпіонаті Тернопільської області. Двічі вигравши золоті медалі в 2002 та 2003 років, 2003 році здобув перемогу в суперкубку.
У 2017 році футбольна команда відновила колишню назву ФСК «Кристал». Здобуває бронзові медалі чемпіонату Тернопільської області, в чемпіонаті України з футболу серед аматорів сезон провалили.
У сезоні 2018-2019 команду очолив Едуард Хавров. Склад ФСК «Кристала» поповнили новачки: Руслан Курдас, Максим Сурженко, Петро Сокіл, Олександр Темерівський. Після змін команда фінішує на 5-му місці в чемпіонаті Тернопільської області, в чемпіонаті України серед аматорів результати також невдалі. Після закінчення сезону командою покинув Едуард Хавров.
3 2020 змінила назву на ФСК «Кристал U-19», напрямок розвитку команди був спрямований на місцевих, молодих гравців. Команда бере участь в першій лізі України з футболу серед команд U-19.
ЗМІ в 2021 повідомили, що «Кристал» може стати фарм-клубом волочиського «Агробізнесу». Команда виступала під керівництвом Сергія Скалія та Олександра Стахіва.