Вулиця виникла в 60-х роках XX століття під назвою Нова. 1971 року отримала назву Якутська вулиця[1]. Протягом 1970—80-х років вулицю значно розширено і продовжено до теперішніх розмірів.
Сучасна назва на честь київської родини Бунґе, яка впродовж майже 300 років розбудовувала у місті Києві промисловість, науку, освіту, банківську та фармацевтичну галузь — з 2022 року[2].
