У дорослому футболі дебютував 2003 року виступами за команду «Расінг» з рідного міста, в якій провів один сезон, взявши участь в 11 матчах чемпіонату.
З 2004 по 2007 рік він грав за «Рівер Плейт» (Монтевідео) у вищому дивізіоні Уругваю. Після цього з січня по червень 2007 року він виступав на правах оренди в клубі іспанської Сегунди «Херес», а з серпня по грудень того ж року також на правах оренди грав за мексиканський «Естудіантес Текос».
5 вересня 2008 року Лопес став гравцем англійського «Вест Гем Юнайтед»[2]. Дебютував уругваєць за «молотобійців» в третьому раунді Кубка ліги проти «Вотфорда» 23 вересня 2008 року[3], а перший матч у Прем'єр-лізі провів 1 березня 2009 року в грі проти «Манчестер Сіті» (1:0)[4]. Тим не менше Лопес не зумів закріпитись в першій команді в зв'язку з наявністю конголезького захисника Еріти Ілунги, тому зіграв у чемпіонаті лише 5 матчів, причому в усіх виходив на заміну, і в кінці сезону 2008/09 покинув лондонський клуб[5].
У липні 2009 року Вальтер повернувся додому, підписавши контракт з «Серро». У серпні того ж року він був відправлений в оренду в італійській клуб з Серії B «Брешія»[6], де уругвайський захисник став основним гравцем. У складі клубу з Ломбардії він провів 31 матч в лізі і два в плей-оф , де «Брешія» перемогла «Торіно» і вийшла до Серії А.
Проте у вищому італійському дивізіоні гравець не зіграв, повернувшись 30 червня 2010 року назад в «Серро», з яким продовжив контракт ще на три роки. Після цього знову був відданий в оренду, цього разу до Румунії, в «Університатю» (Крайова), де зіграв тільки чотири матчі у Лізі I[7].
У липні 2011 року він був проданий в «Пеньяроль»[8], за який дебютував 25 серпня в матчі проти «Белья Вісти». Він забив два голи в 13 матчах в сезоні Апертури 2011 року. У січні 2012 року був відданий в оренду в «Серро Портеньйо» з Парагваю[9], де залишався до 31 грудня того ж року, вигравши чемпіонат Парагваю (Апертура). В січні 2013 року Вальтер повернувся в «Пеньяроль», з яким виграв чемпіонат Уругваю 2012/13.
18 вересня 2013 року перейшов на правах вільного агента в «Лечче»[10], що виступало у третьому італійському дивізіоні. Він дебютував за клуб 29 вересня в чемпіонату проти «Перуджи», а перший гол забив 20 жовтня 2013 року у ворота «Губбіо» (1:1). 30 липня 2014 року уругваєць погодився на ще один рік контракту з «джаллороссі» з автоматичним продовженням ще на два сезони в разі виходу команди до Серії B[11]..
26 червня 2015 року, після двох сезонів з «Лечче», футболіст повернувся до Південної Америки, ставши гравцем парагвайського клубу «Соль де Америка», з яким він підписав контракт до кінця року.
На початку 2016 року захисник втретє відправився до Італії, цього разу «Беневенто»[12], якому в першому ж сезоні допоміг клубу вперше в історії вийти до Серії Б, а за підсумками сезону 2016/17 сенсаційно вийшов з клубом у Серію А. За два сезони відіграв за команду з Беневенто 45 матчів в національному чемпіонаті.
Однак в елітному італійському дивізіоні «Беневенто» вирішив обійтися без уругвайця, який, натомість, продовжив виступи у Серії B, ставши гравцем «Спеції». Згодом провів півроку у третьоліговій «Тернані», після чого став гравцем друголігового клубу «Салернітана».
Виступи за збірну
2006 року дебютував в офіційних матчах у складі національної збірної Уругваю. Всього того року провів у формі головної команди країни 3 матчі.
