Народився 22 лютого1992 року в місті Алма-Ата в сім'ї радянських німців. Його батько також був футболістом, грав за «Кайрат». Коли Меркелю було 6 років, його родина виїхала з Алматинської області на історичну батьківщину в Німеччину, при цьому Меркель зберіг громадянство Казахстану. У Німеччині Александр пішов у футбольну школу клубу «Вестервальд». Через кілька років він став грати за дитячу команду «Штутгарта», потім отримав виклик в збірну Німеччини для гравців не старше 15 років.
2008 року Меркель виїхав в Італію, де його запросили в академію «Мілана». Дебютував в основному складі «Мілана» 8 грудня2010 року в останньому груповому матчі Ліги чемпіонів проти амстердамського«Аякса», вийшовши на заміну на 76-й хвилині замість Робіньйо[1]. 6 січня2011 року дебютував у серії А у матчі проти «Кальярі»[2].
Свій перший м'яч за «Мілан» забив у Кубку Італії, вразивши ворота «Барі» з передачі Робіньйо[3]. У тому ж матчі він також віддав гольову передачу. Всього за сезон Меркель зіграв у 6 матчах чемпіонату, а також по 2 рази виходив в матчах Кубка Італії та Ліги чемпіонів. За підсумками того сезону став з командою чемпіоном Італії.
Перед початком сезону 2011/12 «Мілан» уклав угоду з «Дженоа»: клуби стали співвласниками прав на гравця, крім того, аналогічну угоду було укладено за гравця «Дженоа» Стефана Ель-Шаараві, при цьому Меркель відправився грати за «Дженоа», а Ель-Шаараві — за «Мілан». Проте вже в січні 2012 року «Мілан» повернув Александра назад у зв'язку з травмами основних півзахисників[4], де виступав до кінця сезону, після чого повернувся в генуезьку команду.
У січні 2013 року став гравцем «Удінезе», уклавши контракт на 5 років[5]. Проте закріпитись в новій команді не зумів, зігравши за рік лише у 5 матчах, через що у січні 2014 року він був відданий в оренду в англійський «Вотфорд»[6], де грав до кінця сезону. У липні 2014 року було оголошено про його річну оренду в швейцарський «Грассхоппер»[7]. Проте за цілий рік він встиг відіграти за команду з Цюриха лише 6 матчів в національному чемпіонаті і два у кубку, після чого повернувся до Удіне.
Виступи за збірні
2007 року дебютував у складі юнацької збірної Німеччини, взяв участь у 19 іграх на юнацькому рівні, відзначившись 2 забитими голами.
В березні 2015 року Александр, розуміючи, що потрапити до складу збірної Німеччини або Росії буде дуже важко, погодився виступати у складі національної збірної Казахстану[8]