DrugBank — база даних доступна в Альбертському університеті[1], містить біоінформатичні та хемоінформатичні ресурси, які поєднують в собі деталі препаратів (тобто хімічні, фармакологічні та фармацевтичні) дані з всесторонньою препаративною ціллю (тобто послідовність, структура, шляхи) інформації. База даних станом на 2006 рік, містила інформацію про 4 800 лікарських речовин, включно:
Для 2500 білкових цілей для лікарських речовин, додані їх амінокислотні послідовності[2].
Кожен запис (англ.DrugCard) містить більше 100 полів, з яких більше половини є хімічними і фармакологічними даними, інша половина містить інформацію про цілі дії ліків.
Сайт і база даних DrugBank в цей час підтримується Девідом Уішартом і Крейгом Ноксом[1].
Обсяг і доступ
Усі дані в DrugBank отримані з публічних непатентованих джерел. Майже кожен елемент даних повністю простежується та містить чітке посилання на першоджерело. Дані DrugBank доступні через публічний вебінтерфейс.[3]
Користувачі можуть надсилати запити до DrugBank кількома способами:
Підтримуються прості текстові запити всієї текстової складової бази даних. Натискання кнопки «Огляд» генерує табличний синопсис вмісту DrugBank. Це подання дозволяє користувачам невимушено прокручувати базу даних або пересортувати її вміст.
Натискання кнопки DrugCard відкриває повний вміст даних для відповідного препарату. Там наведено повне пояснення всіх полів і джерел DrugCard.
Кнопка PharmaBrowse дозволяє користувачам переглядати препарати, згруповані за показаннями. Це особливо корисно для фармацевтів і лікарів, а також для фармацевтичних дослідників, які шукають потенційних потенційних клієнтів.
Кнопка ChemQuery дозволяє користувачам малювати (за допомогою аплетів ChemAxon) або писати (як рядок SMILES) хімічну сполуку та шукати в DrugBank хімічні речовини, подібні або ідентичні запитуваній сполукі.
Кнопка TextQuery підтримує більш складний текстовий пошук (часткові збіги слів, чутливість до регістру, орфографічні помилки тощо) у текстовій частині DrugBank.
Кнопка SeqSearch дозволяє користувачам здійснювати пошук послідовностей BLAST (білків) у 18 000 послідовностях, що містяться в DrugBank. Підтримуються запити BLAST як однієї, так і кількох послідовностей (тобто цілого протеома).
Кнопка Data Extractor відкриває простий у користуванні інструмент пошуку реляційних запитів, який дозволяє користувачам вибирати або здійснювати пошук у різних комбінаціях підполів. Data Extractor — це найдосконаліший інструмент пошуку для DrugBank.
Користувачі можуть відстежувати останні новини про DrugBank через регулярні стрічки новин на його вебсайті, а також через Twitter і Facebook.
