Футбольний клуб «Цілинник» був заснований в Янгієрі в 1966 році і представляв місцевий Комбінат будівельних матеріалів і конструкцій.[1] У 1967 році команда дебютувала в класі B середньо-азійської зоничемпіонату СРСР. У червні 1968 року клуб змінив назву на ФК «Янгієр».
У 1970 році після чергової реорганізації ліг СРСР, клуб потрапив до Класу B середньо-азійської зони, та посів у ній друге місце і до 5 зони Другої нижчої ліги Чемпіонату СРСР, в якій виступав до 1989 року. З липня по грудень 1976 року клуб виступав під назвою «Меліоратор» Янгієр, але повернув собі попередню назву.
У сезоні 1990—1991 років грав у зоні 9 Другої нижчої ліги Чемпіонату СРСР.
У 1967 році і в 1976—1978 роках брав участь у Кубку СРСР.
У 1992 році він дебютував у Вищій лізі Узбекистану, в якій виступав до 2000 року, за винятком 1998 року, коли він вилетів до Першої ліги. У 1995 році команда виступала під назвою Динамо (Янгієр).
На початку 2000 року він злився з ФК «Гулистан» і призупинив свої виступи в національних турнірах.
У 2011 році клуб був відроджений під назвою ФК «Янгієр» і команда взяла участь в Кубку Узбекистану та в Першій лізі.
