Під час проведення військових реформ Мануеля Асаньї Аррондо був переведений у резерв до міста Бургос. Там він узяв участь у змові проти Народного фронту. В ніч з 18 на 19 липня 1936 року Давіла разом з іншими заколотниками захопив уряд Бургоса. Пізніше він став членом військової хунти, Державного технічного комітету, ядра майбутнього іспанського національного уряду. Під час громадянської війни Арондо брав участь у північній кампанії, доклавшись до захоплення Кантабрії, Астурії та Біскайї.
Після започаткування націоналістичного уряду очолив його, замінивши формального лідера військової хунти Мігеля Кабанельяса.
