Назва міста — персональний топонім, що походить від особистого імені «Рокас» із додаванням суфікса «-іскіс».
Історія
Паберже, зображений у 17 столітті на карті «Magni Ducatus Lithuaniae, et Regionum Adiacentium exacta Descriptio». Вид-во М.К.Радзивіла, 1613 р. (Фрагмент)
Місто є частиною території, населеної плем'ям селонів. Вперше місто згадується 21 вересня1499 р. у привілеї князя Олександра на вирубку лісу, коли тут стояв Рокишкіський маєток (хоча є думки, що Рокишкіс існував вже у XIII ст.). Напис визначає ліси Рокишкіса та Пьєньоніс. У 1500 згадується Рокишкіський костел і парафія. У 1516 згадується місто. У 1523 Рокишкісі оселилися князі Крошинські, які правили містом 200 років. Згодом маєток Рокишкіс став власністю графів Тізенгаузенів, які побудували туи садибний ансамбль Рокишкіс, неоготичну архітектурну пам'ятку, що збереглася донині - церква апостола євангеліста Матвія.
1810 Рокишкіс згадується як центр повіту, який володів такими дворами та фільварками:
Aknysta (Окніста)
Aukštadvaris (Високий двір)
Veduviškis (Ведерувщина)
Lukštai (Lukszty)
Ignotiškis (Ігналін)
Uljanava (Юліанов)
Рокишкіс (Rakiszki)
Skemai (Skiemiany)
Sėlynė(Litwiniszki)
Rokiškėlės (Ракішечки)
Skrebiškės (Скробішки)
Dagiliai (Догіле)
Kamajai (Comaje)
Будівля центральної площі
Вкінці 18 століття з ініціативи Тізенгаузенів в Рокишкісі були побудовані торговий дім (торговельна палата), готель, пивоварня, цегельний завод, млин, лікарня, школа. Після перенесення маєтка Рокишкіс від ринкової площі міський пейзаж змінився. Центральна площа з трикутника перетворилася на прямокутник і з’єднала садибу на сході з Рокишкіським костелом на заході. В середині 19 століття маєтком Тізенгаузенів заволоділи Пшездзецькі. У 1915 році велика родинна колекція та архів були евакуйовані родиною власників до Києва, де частина колекції була втрачена[1]. Місто почало рости швидше в 1873, коли через нього проклали залізницю[2]
Рокишкіс вважається містом з 18 століття (в інших джерелах — з 1920 або 1924). У 1883 була відкрита музично-співоча школа, яка згодом стала дитячою музичною школою (тут навчалися Юозас Таллат-Келпша, Юозас Груодіс, Мікас Петраускас).
3 серпня1946 Рокишкіс став містом при повіті. За совєцьких часів тут працювали комбікормовий завод, завод сільськогосподарських машин виробничого об’єднання «Неріс», завод дослідних харчових продуктів, сирзавод, комбінат зернопродуктів. Діяли народний театр і культшкола. З 1961 до 1985 працював Аеропорт Рокишкіс, обслуговуючи літаки типу Ан-2, які регулярно літали за маршрутом Рокишкіс-Вільнюс.