Указом Президії Верховної Ради СРСР («закритим») від 26 квітня 1971 року за видатні досягнення у виконанні завдань п'ятирічного плану і організацію виробництва нової техніки Лебедєву Євгену Івановичу присвоєно звання Героя Соціалістичної Праці з врученням ордена Леніна і золотої медалі «Серп і Молот». Став зачинателем руху ленінградців під девізом «П'ятиденне завдання — за чотири дні!».
Помер 18 лютого 1974 року після тривалої важкої хвороби. Похований в Ленінграді (Санкт-Петербурзі) на Красненькому цвинтарі.