Наприкінці 1980-х років довжина розгорнутих головних колій на відділенні становила 1118 км, станційних — 488 км.
Відділенню були підпорядковані 44 станції, 6 локомотивних депо, 3 дистанції колії, дистанція захисних лісонасаджень, дві дистанції сигналізації та зв'язку, енергодільниця, дистанція цивільних споруд, 3 вагонних депо, допоміжні служби — відділи водопостачання та матеріально-технічного забезпечення[2].
У 1992 році розпочався процес уточнення меж залізниць та взаємного обміну дільницями між державами колишнього СРСР.
У 1993 році з Курського відділення Московської залізниці до Конотопського відділення було передано станцію Волфине[3].
Навесні 1994 року на станції Ворожба між керівниками Укрзалізниці, Південно-Західної та Московської залізниць був підписаний акт передачі станцій Тьоткіно, Неонилівка, Крупець та Локоть з Конотопського відділення до Курського відділення Московської залізниці[3].
За підсумком взаємного обміну кількість станцій Конотопоського відділення зросла з 44 до 46[3].
Розташування
Офіс дирекції розташований за адресою: Сумська область, місто Конотоп, вулиця Свободи, 9.
Центр дирекції знаходиться у місті Конотоп — найбільшим на території дирекції. З поміж інших важливих станцій слід зазначити вузлові станції у містах Бахмач та Ворожба.
Залізниці
Через дирекцію проходять магістральна міждержавна електрифікована двоколійна залізниця Москва — Київ та магістральна лінія Київ — Воронеж.
Схеми
Схема руху приміських поїздів на Конотопській дирекції (стенд на ст. Терещенська)
Схема дільниць обслуговування дизель поїздів і рейкових автобусів локомотивного депо Конотоп (схема з вагону поїзда)