Провулок виник у першій половині XX століття під назвою 326-та Нова вулиця, з 1944 року — Голубинна вулиця[1] (фактично продовжували використовувати попередню назву). Сучасна назва — з 1953 року отримав назву Красноводський провулок[2], на честь туркменського міста Красноводськ (нині — Туркменбаші).