Перша жіноча футбольна команда з Харкова в українських змаганнях після розпаду Радянського Союзу. Клуб прийняли до жіночого чемпіонату України 2000 року під назвою «Харків'янка» (Харків).
Перші декілька сезонів команда перебувала в нижній частині турнірної таблиці чемпіонату. У 2002 році «Харків'янка» посіла друге місце в чемпіонаті України, поступившись лише чернігівській «Легенді». Того ж сезону харківська команда програла у фіналі національного кубку вище вказаній команді. Наступного сезону, вже під назвою «Харків-Кондиціонер», клуб виграв чемпіонат, випередивши «Легенду», а також переміг чернігівську команду в фіналі кубку України.
У 2004 році жіноча команда увійшла до структури харківського «Металіста» й почала виступати під вищевказаною назвою[1]. Як і попереднього року, «Металіст» виграв чемпіонат України, випередивши «Легенду», а також обіграв у фіналі національного кубку вищевказану команду.
Наприкінці 2004 року віце-президент «Металіста» Віталій Данілов після конфлікту з президентом залишив «Металіст», після чого на базі чоловічої команди «Арсенал», що виступала в Першій лізі, було створено футбольний клуб «Харків». Жіноча команда хоч і теж входила в цю структуру, проте залишила назву «Арсенал».
«Арсенал» здобув срібні медалі вищої ліги, але на наступний сезон не заявився через відсутність фінансування. У 2006 році колишні гравчині «Арсеналу» майже всім складом приєдналися до новоствореного клубу «Житлобуд-1»[1].
