Андреас Юганссон народився у місті Гальмстад і з п'ятнадцяти років почав займатися в академії місцевого клубу «Гальмстад». У 2002 році футболіст дебютував у першій команді і швидко зарекомендував себе як гравець основи. За сім сезонів перебування в клубі найбільшим успіхом для Юганссона стало друге місце в чемпіонаті 2004 року.[1]
Влітку 2009 року Юганссон перебрався до Німеччини, де приєднався до клубу Бундесліги«Бохум».[2] Але вже в першому сезоні «Бохум» вилетів до Другої Бундесліги.
У січні 2012 року Юганссон повернувся до Швеції, де підписав трирічний контракт з клубом «Норрчепінг».[3] Пізніше термін дії контракту було продовжено. З «Норрчепінгом» Андреас ставав чемпіоном Швеції та вигравав Суперкубок країни.
У 2019 році після завершення контракту Андреас Юганссон повернувся до свого рідного клубу «Гальмстад».[4]