Ібрахім Сіссоко народився у нідерландському місті Неймеген у родині гвінейських переселенців.[1] Він вихованець футбольних академій клубів «Вітессе» та НЕК «Неймеген». У 2016 році футболіст приєднався до молодіжної команди НЕКа. Починаючи з сезону 2021/22 футболіста почали залучати до першої команди «Неймегена». 29 квітня 2022 року у матчі чемпіонату Нідерландів проти «Утрехта» Сіссоко дебютував на професійному рівні.[2] У липні 2022 року Ібрахім підписав з клубом контракт до літа 2024 року з можливістю в подальшому продовження співпраці з клубом.[3]
У червні 2023 року Сіссоко приєднався до клубу французької Ліги 1«Тулуза».[4] Але через отриману влітку травму стопи дебютував за новий клуб зміг лише 5 листопада 2023 року.[5]